為提升學術及科研的國際化水平，共同培養具有跨學科研究能力的科研人員及博士研究生，香港浸會大學饒宗頤國學院與多所國際知名研究機構簽署了長期科研合作夥伴協議，包括（依簽署協議日期先後）：
復旦大學出土文獻與古文字研究中心
牛津大學皇后學院寫本與文本文化研究中心
俄羅斯科學院東方研究所
